Polymorphism of SSR Markers Based on the Whole Genome Sequence of Lentinula edodes and Use in Strain Identification
【作者】 张丹； 巫萍； 章炉军； 唐利华； 宋春艳； 尚晓冬； 鲍大鹏； 谭琦；
【Author】 ZHANG Dan 1,WU Ping 1,2,ZHANG Lujun 1,TANG Lihua 1,SONG Chunyan 1 SHANG Xiaodong 1 ,BAO Dapeng 1,TAN Qi 1(1 Institute of Edible Fungi,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Key Laboratory of Edible Fungi Resources and Utilization(South),Ministry of Agriculture,P.R.China;National Engineering Research Center of Edible Fungi,National R&D Center for Edible Fungi Processing,Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding of Shanghai,Shanghai 201403,China : 2 College of Life Sciences,Nanjing Agricultural University,Nanjing,Jiangsu 210095,China)
【机构】 上海市农业科学院食用菌研究所,农业部南方食用菌资源利用重点实验室,国家食用菌工程技术研究中心,国家食用菌加工技术研发分中心,上海市农业遗传育种重点开放实验室； 南京农业大学生命科学学院；
【摘要】 利用香菇(Lentinula edodes)全基因组序列信息开发的35个香菇SSR(simple sequence repeat)分子标记用于中国25个香菇品种的鉴定。所选SSR标记共检测出174个条带,各引物检测到的条带数量变化范围为2～12。筛选出的7对SSR引物组合显示了良好的品种特异性鉴定能力,可以有效地鉴定部分国审香菇品种。
【关键词】 香菇； 全基因组序列； SSR； 品种鉴定；
【文内图片】
图１香菇１３５菌株单核体和转录组的ＳＳＲ标记分布Ｆｉｇ．１ＤｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆＳＳＲｓｉｎｍｏｎｏｋａｒｙｏｎｓａｎｄｔｈｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｏｆＬ．ｅｄｏｄｅｓ１３５
图２香菇１３５菌株单核体和转录组的ｍｏｔｉｆ类型次数分布Ｆｉｇ．２ＤｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆＳＳＲｍｏｔｉｆｓｉｎｍｏｎｏｋａｒｙｏｎｓａｎｄｔｈｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｏｆＬ．ｅｄｏｄｅｓ１３５
【基金】 上海市科委重点科技攻关项目(编号:10391900900);种业发展专项[编号:沪农科种字(2012)第6号]的部分研究内容~~
【分类号】S646.12