菌丝后熟，即菌丝的后期再培养，其含意是指菌丝发满菌袋后，创造条件使之继续进行营养生长、延长发菌时间，该阶段即为菌丝后熟期。
延长菌丝后熟期之所以能够获取大幅度的增产效果，其理论依据是：出菇的多寡，是以菌丝数量为前提的，也就是说，生物量（菌丝数量）越大，出菇量越多，二者呈正比关系。
众所周知，食用菌的生长发育，除了营养、水分等物质条件外，温度、通风、光照等因素是不可或缺的条件，只是因品种的生物特性而有所区别，这在技术上称做“食用菌六大生活条件”；菌丝后熟之所以能够增产尤其第一潮菇可呈爆发之势，其基本原理是：菌袋完成初步发菌后，一旦感到诸如温差、光照等外部条件的不适之后，即可很快现蕾出菇，作为一种生物，当该条件不适于继续发展菌丝、应该快速繁衍后代；但由于此时基料内生物量不足，尤其基料内部的菌丝尚未达到生理成熟，表层菌丝扭结现蕾，其出菇产量尤其是第一潮的产量当然不会很高。以平菇为例，大量的咨询者均诉说产量低下的苦恼，第一潮菇的生物学效率达不到50%，导致整个栽培周期拖长、占用栽培设施、占用大量管理用工以及病虫害频发等，生产效益难以有效提高，究其原因：在其它条件相同的情况下，菌丝后熟培养时间不足，是制约产量大幅提高的主要因素。菌丝后熟，是笔者在多年的科研开发实践中不断试验、分析基础上，通过一系列验证实验和总结后提出来的新理念，尤其对于调配基料营养之后的栽培，更是显示出该措施的高产优势。其基本做法是：
一、调配基料营养
生产者大多看重基料的碳氮比，但又限于手头资料的缺乏或不会计算等，也只能是任其自然；实际上，食用菌的健壮与否，不但是碳氮比的问题，与基料内的营养是否全面、是否均衡等关系密切。现一般的做法是，在配料时加入“食用菌三维营养精素”，每250公斤原料中加入120克，即可满足菌丝对营养的需求。
二、严格避光培养
自播种开始，即应严格避光，尤其进入发菌棚以后，相当部分菇农为方便观察，习惯将棚内光照调整至明亮，表面看对发菌似无影响，但是，一旦完成初步发菌后，菌袋即可现蕾；正确的做法是，保持避光培养，进棚观察时可掀开草苫或开灯，人走“光”灭。
三、避免温差刺激
尤其菌丝发满菌袋以后，稍加温差刺激，菌丝即可扭结现蕾，尽管出菇数量很小，但是，一旦出菇，就是在菌丝没有充分后熟的情况下发生的，所以最终难以有理想的出菇数量。避免温差刺激的主要做法，就是根据气温条件，适当调控发菌棚的温度，尽量避免棚内温差过大，有条件的可安装水温空调，即可有效的解决该问题。一般要求在菌袋表面发满菌丝后，保持偏低一些的温度如15℃左右并力求稳定为宜，夏季可适当提高至25℃以下。
