南方灵芝中一种新型免疫调节蛋白的生物信息学分析

【作者】王莹 高英女 汪滢 李燕 唐利 华白睿 鲍大鹏
【机构】国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海海洋大学食品学院
摘要：利用生物信息学方法从蛋白质基本理化特性、信号肽和亚细胞定位、分子进化与翻译后修饰位点以及蛋白质三维结构等方面,对南方灵芝(Ganoderma australe)中免疫调节蛋白c13717进行预测分析,并将c13717蛋白的分析结果与三种典型的真菌免疫调节蛋白(LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo)以及牛樟芝(Antrodia camphorata)中免疫调节蛋白ACA进行比较分析。结果发现,c13717蛋白相对分子质量为14150,N端具有信号肽,亚细胞定位于细胞外,遗传进化与ACA相近,而与LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo较远,翻译后修饰位点较少,蛋白三维结构含有cerato-platanin(CP)结构域,不具有真菌免疫调节蛋白典型的FNIII结构,证明c13717蛋白不属于真菌免疫调节蛋白(fungal immunomodulatory protein,FIP)家族,而属于CP蛋白家族,可能具有独特的生物活性。
基金：上海市农口青年人才成长计划[沪农青字(2015)第1-11号]、上海市农口青年人才成长计划[沪农青字(2015)第1-10号]项目资助；
关键词：南方灵芝; 理论预测; 结构特征; 免疫调节蛋白;