【作者】 陶永新； 黄千慧； 陈仁良； 谢斌； 连玲丹； 张磊； 丁宇斯； 江玉姬； 谢宝贵；
【Author】 TAO Yongxin;HUANG Qianhui;CHEN Renliang;XIE Bin;LIAN Lingdan;ZHANG Lei;DING Yusi;JIANG Yuji;XIE Baogui;College of Horticulture,Fujian Agriculture and Forestry University;Mycological Research Center,College of Life Sciences,Fujian Agriculture and Forestry University;College of Food Science,Fujian Agriculture and Forestry University;
【机构】 福建农林大学园艺学院； 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心； 福建农林大学食品科学学院；
【摘要】 依据草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,采用ZOOM软件将转录组Reads定位到基因组的分析方法,从草菇中鉴定了一个多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1,对其进行生物信息学分析,并对其高效诱导物进行筛选,采用定量PCR方法研究其在降解稻草时表达量的变化规律。结果表明:草菇Vv-lpmo1基因DNA序列长1432bp,有9个内含子,预测编码305个氨基酸的蛋白质;生物信息学分析表明该蛋白质有分泌信号肽,且含有两个完整的保守结构域:N端的glycoside hydrolase family 61(GH61)结构域和C端的cellulose-binding domain(CBD)结构域。通过对葡萄糖、无碳源(饥饿诱导)、微晶纤维素、滤纸、稻草和木屑6种不同基质诱导草菇菌丝的定量PCR,结果筛选出稻草对Vv-lpmo1基因有最强的诱导作用。进一步研究稻草诱导不同时间的变化过程中,该基因的表达规律为0~4h先下调;4~12h恢复到初始水平;12h以后开始迅速上调并维持较高水平。本研究表明草菇多糖单加氧酶基因Vv lpmo1属于诱导表达型基因,可能在草菇降解稻草基质中起着重要作用。
【关键词】 草菇； 多糖单加氧酶基因； 定量PCR； 表达量；