时值野生羊肚菌生长采集阶段，本章节主要来扒一扒羊肚菌鉴别问题。
羊肚菌的鉴别是一个有意思和非常重要的工作，采集到的任何一个羊肚菌标本，如果没有初步的判断认识，不能在一定知识水平上判断出是何种羊肚菌，无论对采集者而言还是对生产者而言，都是没有意义和非常危险的事情（美食家除外）。没有一个准确的名称，就无法在学术届进行科学的交流；在当前还不是每个羊肚菌种都能栽培的情况下，不知道种性的情况下，直接进行扩大生产也就是极其危险的事情了。
羊肚菌属的分类一直是比较困难的事情，常因为环境和气候等外界条件的变化会导致羊肚菌子囊果的形状、大小、特别是颜色的改变，甚至同一物种不同发育阶段的形态特征都有较大变化，如在不同光照强度下，羊肚菌的颜色可能是黄棕色、棕色，也可能是黑色、褐色，加之用于区分羊肚菌属物种的显微特征较有限，该属内的物种界定一直是个悬而未决的难题，同物异名和异物同名的现象严重，羊肚菌种也是纷繁复杂的，截止2015年4月，根据英国真菌索引数据库提供的资料显示，羊肚菌属下的分类名称已达317个（含种、亚种和变种等）。
传统的分类系统中，主要根据菌盖近中部与菌柄是否分离、菌盖边缘是否明显向外伸展、菌盖的形状和颜色、盖表棱纹排列和凹坑的深浅、以及子囊果的子实层和菌柄变红与否、子囊及子囊孢子等特征，将羊肚菌分为不同的大类：黑色羊肚菌类、黄色羊肚菌类和变红羊肚菌类，早期也有人认为半开羊肚菌也是单独的一个类群。
分子生物学技术的飞速发展带来了真菌的分类和系统发育研究的革命性变革，为了避免传统物种分类的主观性，有人提出了使用多基因一致性的系统发育学物种识别方法，简单来说，就是基于多个保守的基因序列进行系统发育学分析，这样就能更准确的反应物种的进化关系。在对羊肚菌属进行多基因系统发育分析表明，羊肚菌整体分为三大类群，早期单独划分出来的半开羊肚菌应属于黑色羊肚菌类群。即羊肚菌属应为三大类群：黑色羊肚菌类、黄色羊肚菌类和变红羊肚菌类。现代分子分类系统研究也表明其中黄色羊肚菌支系和黑色羊肚菌支系是姊妹类群，构成羊肚菌属内的两大主要类群，变红羊肚菌支系是该属的基部类群，是最古老的类群。这里公布一下前面一个章节中的图片说明，其中2号为红色羊肚菌类群，3-10号为黄色羊肚菌类，11-19号为黑色羊肚菌类，怎么样，与你的判断一致么？
近年来的研究表明，中国分布有17个黄色羊肚菌品系和13个黑色羊肚菌品系，分布在我国的绝大部分省区，但目前在我国未发现有变红羊肚菌的物种。从地域植被区域划分，我国的30 种羊肚菌中，其中20 个物种分布于中国‐日本森林植物亚区，17 个分布于中国‐喜马拉雅植物亚区，4 个分布于青藏高原亚区，4 个分布于欧亚森林亚区，1 个物种分布于马来西亚亚区（下图中黑色三角代表黄色羊肚菌种，黑色圆圈代表黑色羊肚菌种）。
无论是传统的形态学分类还是分子生物学分类，没有一定基础知识和实验条件的个人或团队都是无法进行的，不能仅凭一张照片或几个标本根据有限的比较去判别是何种羊肚菌，如特殊需要，可以求助于有实力的科研机构或研究所，特别要强调的是，大规模生产以目前广泛推广的几个品种为主，其他羊肚菌品种仅以适当的驯化实验为宜。
刘伟授权易菇网独家刊载，未经许可，禁止转载。
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