羊肚菌生长发育的第一个阶段，即原基阶段。我们定义：最初的针尖状扭结期到羊肚菌菌柄和菌盖表型分离完成为原基阶段。
虽然原基阶段都已经能用肉眼观察得到，但如果你有放大镜等装备，用上会更好。
原基的发育整体可分为四个阶段，
阶段1：针尖期，这个阶段也是可以用肉眼观察得到，但也是最难观察的，有装备更好，在光滑的泥块上更容易发现，是菌丝扭结开始形成原基的第一阶段，大小和针尖差不多，故我们称之为针尖期，用高科技手段，在扫描电镜极限放大观察时可以看到在泥块的表面，纤细的菌丝扭捏成结点，这中“结”是平坦的圆盘状菌丝团，如下图所示：
第二阶段，球形原基阶段，24小时之内，盘状结开始膨大成球形结构，在结的中部开始出现最初的原基形态，即球形原基阶段。这时候是比较容易用肉眼观察得到的，在水分充足或刚下过雨的时候，看到的是水浸状的，感觉是一个球形肉色水珠，下面图上可以看到不下40个球形原基，大家找一找
再附上一张极限放大的球形原基图片，其实这里，原基已经开始有增大变长的趋势了：
第三阶段：原基伸长阶段，原基开始增长发育阶段，最明显的特征是原基有前一阶段的球形拉伸成长锥形，嫩嫩的，肉白色，幼嫩。基部开始连接着土壤培养基的部分增大，以支撑菌柄继续发育的需要，这一阶段已经非常容易找到。看图说话：
第四阶段：原基分化阶段，这一阶段最明显的特征是菌盖和菌柄的形态特征开始分化显现，开始真正开始有羊肚菌的样子。这个时候，菌柄的下部开始变圆变大，变圆变大的柄使子囊果有一个宽大的基部牢牢地结合在培养基上支撑菌盖的发育。偶尔可见到膨大的菌柄基部有自然的开裂状沟壑，这也表明，菌柄开始形成中空状态。前子囊也开始在原基顶端出现
好了，到此原基基本形成，该阶段是栽培过程中极其关键的阶段，是令人兴奋也是令人伤心难过的阶段，兴奋的是，一年的辛苦，终于可以看到希望，心碎的是，这么多原基，一旦遭受不测，将很容易夭折。时间关系，我们后期继续跟进相关的栽培经验。
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