金针菇基因组SSR位点分析及标记开发

【作者】金群力 沈颖越 蔡为明 周烁红 范丽军 冯伟林 宋婷婷 李良英 田芳芳
【机构】浙江省农业科学院园艺研究所 浙江师范大学化学与生命科学学院
摘要：以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选。统计结果表明,金针菇基因组有1279个位点,SSR位点密度为35.53/Mb,并以三核苷酸基序为主,重复数≥10的SSR(即高频)基序数目总计246个,占所有SSR位点的19.23%。设计的16对SSR标记均能扩增条带,多态率仅为18.75%。
基金：浙江省农业新品种选育重大科技专项-食用菌新品种选育(2012C12911)； 国家自然科学基金项目(31401930)资助；
关键词：金针菇基因组; SSR位点; 多态性标记;