【作者】 杜慕云； 杨仁德； 李剑； 谢宝贵；
【Author】 DU Muyun;YANG Rende;LI Jian;XIE Baogui;Guizhou Soil and Fertilizer Institute;Mycological Research Center of Fujian Agricultural and Forestry University;
【机构】 贵州省土壤肥料研究所； 福建农林大学菌物研究中心；
【摘要】 基于草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,通过生物信息学的方法对草菇α-淀粉酶基因进行基本理化性质、内含子和外显子结构、信号肽、亚细胞定位和功能位点的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明:编码草菇α-淀粉酶的基因有5个,分别为GME2151、GME6695、GME9075、GME10698和GME10705;5个基因编码的蛋白相对分子量介于38.8~64.6kD之间,磷酸化以Ser位点为主,大都存在信号肽,亚细胞定位在细胞外,保守结构域和空间结构相似度较高。和其它的担子菌一样,草菇α-淀粉酶可以分为两类:GME9075和GME10698归为α-淀粉酶Ⅰ类,GME2151、GME6695和GME10705属于α-淀粉酶Ⅱ类。 更多还原
【关键词】 草菇； α-淀粉酶基因； 生物信息学；
【文内图片】
【基金】 草菇育种岗位(编号:CARS 24);黔科合体(编号:Z字2013-4006号)的部分研究内容