进入夏季以后，棚内温度升高，多数食用菌生产也进入尾声。歇茬期内，如何做好棚室消毒就成为当前菇农的首要工作。专家提醒广大菇农朋友，菇棚消毒要做好以下三点：
彻底清棚
将棚内食用菌生产废料全部清除出棚，地面打扫干净。没有清理出棚的食用菌废料，不仅容易滋生杂菌，导致棚内病原菌孢子量增大，不利于消毒，而且菇蝇等食用菌害虫也大量繁殖，为以后食用菌生产埋下隐患。所以，食用菌生产后的废料一定要彻底清理出棚，且不能堆积在距离菇棚较近的地方，以防废料中的病菌、害虫继续进入棚内。
药剂消毒
菇农可选择硫磺、甲醛-高锰酸钾、二氯异氰尿酸钠等熏蒸杀菌。这三者之中，硫磺燃烧后产生的二氧化硫能够起到杀菌、杀虫的双重效果，但使用时产生的二氧化硫容易与空气中的水蒸气接触，形成亚硫酸，腐蚀菇棚内的钢丝等。使用甲醛-高锰酸钾消毒时，则要注意先倒粉剂后倒水剂，即先将高锰酸钾倒入容器中，然后再将甲醛倒在高锰酸钾上，以免甲醛与高锰酸钾反应剧烈，药液溅在身上。二氯异氰尿酸钠使用方法最为简单，只要按照每立方米空间3克的用量，按照每亩15-25个点将药剂设置在棚内，点燃即可。
有条件的菇农可先将菇棚上部的棚膜撤掉，利用紫外线杀菌，同时通过雨水淋洗，在自然条件下让土壤中的有益微生物大量繁殖，抑制菇棚病菌的发生，在新料进棚之前再用药剂消毒。现在还有些菇农使用臭氧消毒机杀菌消毒，这里需提醒菇农的是，因为臭氧消毒机功率不同，杀菌范围也不同，对于面积较大的菇棚，菇农应先用棚膜隔开，分段消毒，以保证消毒效果。
通风排气
当菇棚杀菌消毒完成后，菇农要注意及时通风换气，将棚室内的有毒气体排出棚外，以便于以后食用菌的种植。
