双孢蘑菇栽培料的厚薄影响到产量的高低。一般说来，铺料厚度在25～35厘米，料厚度大，营养充足，出菇早、转潮快、产量高；料偏薄时，菇的潮次少，转潮期拉长，菇易早衰，菇体细小，产量低下。但是铺料的厚度应与发菌期的温度和出菇时间同时考虑，例如在温度较高的8月初播种和发菌，为了防止菌床上菌丝生长时产生的热量不易散出造成烧菌，所以培养料应铺薄些，以25～30厘米为宜，如菇棚温度偏低或发菌和出菇期自然温度都较低，料就应铺厚些，以铺30～35厘米为宜。如西部冷凉地区的半地下菇棚，整个发菌和出菇期温度都较低，料还可以再厚一些。实践经验表明，料温过低影响产量。
