【作者】朱兆香 曾昭清 庄文颖
【机构】中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心
【摘要】木霉属真菌是一类重要的生物资源,在工农业、环境保护等方面具有较高经济价值,对其进行快速、准确的物种鉴定兼具理论意义和应用前景。以木霉属35个概念清晰的种为材料,选择I TS、rpb2和tef1作为候选基因序列,利用T axon Gap对231个序列片段进行分析,将种内与种间序列差异以及序列获取难易程度作为评价指标,筛选该属的补充条形码片段。结果表明,r pb2具有适宜的种内与种间序列差异,其最小的种间差异(2.48%),大于最大种内差异(1.8%),种内、种间遗传距离存在明显的间隔区,并且该基因序列具有较高的P CR扩增与测序成功率(94.4%);I TS和t ef1基因序列的种内与种间序列差异之间存在交叉重叠。因此建议r pb2作为木霉属的补充D NA条形码序列。
【基金】Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31270073)； Ministry of Science and Technology of China for Fundamental Research(No.2013FY110400)；
【关键词】种内与种间序列差异; PCR扩增与测序成功率; rpb2;