草菇翻译起始因子Vv‐IF4E及与其共表达转录因子的研究

【作者】陈仁良 严俊杰 陶永新 谢斌 张磊 吴塔菊 李少杰 谢宝贵
【机构】福建农林大学生命科学学院菌物研究中心 福建农林大学园艺学院 中国科学院微生物研究所
摘要：真核翻译起始因子IF4E(initiation factor 4E)可通过与m RNA的5’帽子端结合,在蛋白质的翻译起始过程中扮演重要角色。草菇Volvariella volvacea是一种富有商业价值的食用真菌,其生长发育与蛋白质的合成代谢密切相关。本文通过鉴定草菇编码IF4E的基因(Vv-IF4E),并根据生物信息学和实时荧光定量数据分析Vv-IF4E及相关转录因子基因表达量的变化规律。结果显示,草菇Vv-IF4E基因上游存在较多顺式作用元件,基因存在4种可变剪切体,只有一种具有翻译起始因子的保守结构域。预测开放阅读框(ORF)长度为3 083bp,所编码蛋白分子量为87.1k Da,存在35个磷酸化位点。Vv-IF4E蛋白结构有异于拟南芥IF4E,但与皱木耳Auricularia delicata IF4E相似。实时荧光定量结果表明,Vv-IF4E与转录因子YRR1、ECM22存在极强的共表达规律。
基金：国家重点基础研究发展计划(973计划)(2014CB138302)； 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS24)*；
关键词：草菇; 蛋白质合成; 荧光定量PCR; 共表达; 皮尔森相关系数;