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SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征

2019-01-21 17:08来源:菌物学报214
◆内容导读AI 摘要 · 1 分钟读完

【作者】周雁 范秀芝 陈连福 边银丙 【机构】华中农业大学应用真菌研究所 【摘要】以黑木耳和毛木耳转录组测序获得的转录本序列为基础,采用软件SSR Locator对两个物种中SSR的数量、分布和结构特征等方面进行分析,发现毛木耳中SSR的丰…

黑木耳; 毛木耳; 转录组; 简单重复序列; 基序;
【作者】周雁 范秀芝 陈连福 边银丙
【机构】华中农业大学应用真菌研究所
【摘要】以黑木耳和毛木耳转录组测序获得的转录本序列为基础,采用软件SSR Locator对两个物种中SSR的数量、分布和结构特征等方面进行分析,发现毛木耳中SSR的丰度和密度较黑木耳小。在两者的SSR中,三碱基和六碱基重复的出现最多。对含量最多的三碱基重复序列的基序进行分析表明富含GC的SSR在这两个种的转录组中占优势地位。  
【基金】中国博士后科学基金(No.20110491164);
【关键词】黑木耳; 毛木耳; 转录组; 简单重复序列; 基序;
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