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杏鲍菇漆酶基因DNA片段的克隆及序列分析

2014-02-28 16:271800
  【作者】 薛丹; 郭九峰; 那日; 刘腾; 
 
  【机构】 内蒙古大学自治区离子束生物工程重点实验室; 
 
  【摘要】 参照Genbank中发表的杏鲍菇漆酶基因序列(No.AY686700),并根据真菌漆酶氨基酸序列保守区设计特异性引物。以杏鲍菇基因组DNA为模板,PCR扩增出长2 606 bp的漆酶基因片段,DNA经纯化后克隆到pGM-T载体上,经筛选、PCR鉴定和序列分析,证明该片段为完整的杏鲍菇漆酶基因(Genbank注册号KC789846)。通过对基因序列的内含子/外显子进行预测分析,获得漆酶编码区的cDNA,该基因的开放阅读框由1 596个核苷酸组成,编码一个由531个氨基酸组成的多肽,分子量大小约为56 682.0,等电点pI为4.56;比对结果发现该基因氨基酸序列与其他真菌漆酶的同源性最高达93%;进一步对X22-12漆酶二级结构进行分析,并通过SWISS-MODEL预测了该酶的三维结构。 
 
  【关键词】 杏鲍菇; 漆酶基因; 基因克隆; 序列分析; 
 
  【基金】 国家自然科学基金(No.51267014)
 
  【分类号】S646 
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