针对以上问题，刘杏忠提出了四点产业发展建议：一是构建食药用菌菌种库及优良菌株选育，资源共享与创新需要国家、企业与研究机构共同构建，研究机构应针对共性的产业菌种问题开展育种研究为主，以研究机构为主体开展野生食药用菌驯化，企业进行菌种复壮和选育为主。二是开展共性技术培训提升基本技术。三是实现产学研真正结合和互动，企业依托科研机构进行关键技术研发，例如与深圳合作开展的“微生物及酶在烟叶增香中的应用”，与牛栏山的合作研发的“酿酒过程中的微生物多样性及作用”等，科研机构在企业共建研发基地实现产学研的结合和互动。四是要有现代产业的企业观念，刘杏忠提出要靠现代企业理念和规范做产业，开拓创新，靠领先的技术和管理机制运营企业，加强研发团队建设和资金投入，拓宽思路，开展新产品研发。
据悉，真菌学国家重点实验室于2011年10月经科技部批准建设，固定人员72人、包括研究员16人、副研究员13人、助理研究员31人、研究实习员5人。拥有菌物标本馆、菌种库、代谢产物库、基因库、数据库等资源研究平台，生物信息学分析平台、分类鉴定和分子生态研究平台、遗传操作和蛋白表达平台、次级代谢产物研究平台等技术支撑平台，以“面向学科前沿，面向国家需求，进入国民经济主战场”为宗旨，与省部级重点实验室共建“联合实验室”，与企业合作建立“联合研发基地”。
