时下，一些食用菌种植者不管市场的需求及销售方式的不同，盲目选择栽培品种，给生产带来不小的影响，造成种植效益的下滑。为此，有关专家提醒菇农，一定要根据市场选择品种。
目前可供人工栽培并可形成商品化栽培的食用菌品种有20多个，市场上常见的只有近10个品种，其他品种不能大量上市的原因，无非是技术难度大、商品性低、消费者认知度低、消费水平制约以及不能出口等，这就是说，要做生产，首先应考虑市场因素，笔者根据多年的研发经验和调研分析，主要应根据以下几个方面进行选择：
以当地市场销售为主 作为地销鲜菇产品，在市场要有“卖相”，即商品性，大多消费者选择个头大而均匀、色泽正常、洁净度高的鲜菇，因此，菌株的选择应以块（个）头适中或偏大、表面鲜亮、洁净度高的菌株为主；生产中配合诸如降低棚温、喷施三维精素等措施，即可产出理想的菇品；如平菇的8359，鸡腿菇的Cc528等春季用种，或夏季选用鲁夏一号平菇、小平一号姬菇、V23草菇等品种，作为当家品种，很受消费者欢迎。
可以长途运输 直接进入批发市场的菇品，一般应为个头适中、均匀、含水率偏低的标准，配合降低湿度和温度、提前采收、严格分级等措施，即可满足该要求。如低温平菇2006、特抗一号，金针菇白金，香菇鲁花一号，高温时段的木耳黑花一号等，均可满足批量栽培的要求。
仿工厂化生产，做鲜销出口 主要是双孢菇、香菇等少数品种，该类生产，最好要求对方提供菌种后进行生产，合作愉快的话，也可根据收购方的要求选定菌种，并实施严格的生产标准进行管理及采收分级。牵涉日本“肯定列表制度”的实施，签订对日出口订单时，一定要由进口商提供菌种及技术，以规避贸易风险。
烘干加工 如香菇、木耳、茶树菇、杨树菇、柳松菇、草菇等，既可鲜销，亦可制干，但前者往往会发生独木桥事件，后者则可囤积销售，尤其进入元旦前一个月，干品往往成为争购对象；该类生产宜选个头大、菌盖厚、开伞迟的菌株，如春秋季节的鸡腿菇Cc528、柳松菇鲁柳一号以及茶树菇5号，冬春季节的鲁花一号香菇等，如使用鸡腿菇Cc83菌株时，可临时采取加厚覆土等措施，以促使菇体粗大。
以销售腌渍品为主 多年来腌渍品以平菇、鸡腿菇、双孢菇、金针菇、姬菇（袖珍菇、小平菇）等为主，生产中应选个头中等、色泽较好的菌株，配合相应技术措施，促使多现蕾，夏季采取遮阴降湿度、冬季则宜采取保温通气等措施，使菇品保持洁净，七八分熟采收即可满足要求。
以销售罐头为主 制罐品种多以双孢菇、鸡腿菇、姬菇、金针菇等大路品种为主，宜选小个型菌株，要求色泽洁净、个头均匀，与腌渍菇加工相同。
