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灵芝菌株的DNA指纹分析

2006-03-17 00:000食用菌网

灵芝菌株的DNA指纹分析 罗联忠  林树钱  谢宝贵  林志彬  摘 要:CTAB法提取灵芝菌丝体总DNA,再以核糖体DNA转录间隔区(ITSⅡ、IGR IPCR RFLP)结合随机引物扩增多态性(RAPD)标记分析30个灵芝菌株间的亲缘关系.结果表明,ITSⅡ、IGR I-PCR RFLP产生了47条带,其中42条显示出多态性,通过聚类分析将30个菌株分成七大类,包括紫芝、黑灵芝、树舌灵芝、薄树灵芝四大类,以及另外三个无法确定具体归属的类群,但没能将赤芝与松杉灵芝区分开.RAPD从247个随机引物中筛选出8个随机引物,共检测到69个多态性位点并全部显示出多态性,通过聚类分析将供试的30个灵芝菌株全部区分开. 关键词:灵芝;核糖体DNA转录间隔区;随机引物扩增多态性 分类号:S567.310.1  文献标识码:A 文章编号:1005-9873(2005)03-0007-07 DNA Fingerpinting Analysis of Ganoderma Strains LUO Lian-zhong  LIN Shu-qian  XIE Bao-gui  LIN Zhi-bin  基金项目:绿谷集团有限公司灵芝专项科研资金全额资助项目"灵芝菌种DNA鉴别"(项目编号:2003SHGV01),福建省星火计划项目"福建食用菌集聚产业科技服务体系建设示范--食用菌种质资源库建设、分类与认定前期技术研究"(项目编号:2003EAT20021)的部分研究内容 作者简介:罗联忠(1978-),男,2004年毕业于福建农林大学,硕士,主要从事药用真菌的种质资源收集与分子鉴定等工作,发表主笔论文4篇. 作者单位:罗联忠(福州绿谷生物药业技术研究所,福州,350002;福建农林大学菌物研究中心,福州,350002)       林树钱(福州绿谷生物药业技术研究所,福州,350002)       谢宝贵(福建农林大学菌物研究中心,福州,350002)       林志彬(福州绿谷生物药业技术研究所,福州,350002;北京大学医学部药理系,北京,100083)  参考文献: [1]赵继鼎,张小青.中国真菌志(第十八卷,灵芝科)[M].北京:科学出版社,2000.25. [2]中华人民共和国药典委员会.中华人民共和国药典[M].北京:化学工业出版社,2000.222. [3]卫生部.卫生部关于印发真菌类和益生菌类保健食品评审规定的通知[B].卫法监发[2001]84号. [4]Makimura K. Phylogenetic classification and species identification of dermatophyte strains based on DNA sequences of nuclear ribosomal internal transcribed spacer 1 regions[J]. Clin Microbiol, 1999,37(4):920. [5]李国利.16S~23S rDNA内转录间隔区序列分析及其在分支杆菌鉴定中的应用价值[J].中华结核和呼吸杂志,2002,25(3):166. [6]Williams JG, Kubelik AR, Livak KJ, et al. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful genetic markers[J]. Nuc Axids Res, 1990,18:6531~6535. [7]Welsh J, McClelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers[J]. Nuc Acids Res, 1990,18:7214~7218. 食用菌学报 2005年第3期-HTM文件 No.2

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