银耳一般周期段，大家在中期也应注意病虫害及杂菌的感染，防治感染传播面积扩大，下边我的概述如下：
银耳致病主要有白粉及杂菌感染，一般杂菌有青霉、毛霉、根霉、木霉和各种曲霉，可用75％的酒精注射杀灭 （要用胶布封针口）。白粉病为害极大，发展也较迅速，严重时可使整桨无收，一般可用石灰硫磺合剂对室内墙壁、地面喷撒，也可在为害部位擦拭。害虫一般有食菌螨、线虫，在夏秋季，特别是出现烂耳时，蝇的为害较为严重，爬舔生蛆；使烂耳迅速传染扩大。防治的方法可用药物如10％～20％的乐果、敌敌畏、三氯杀螨醇等进行喷撒或熏蒸，但不能直接用于耳朵，以免银耳留下残毒。 对病虫害应本着防重于治的方针，按照无菌操作的要求，对培养基、培养室及各种用具彻底消毒灭菌。对周围环境要保持干净，消除病虫源，病虫害危害严重者要彻底隔离淘汰。
造成杂菌感染的原因，是由多方面的因素构成的，如季节、环境等。但主要是没有按照无菌操作的要求去进行。如培养基灭菌不彻底、接种室接种管和所用工具消毒灭菌不良、操作人员的个人卫生欠佳，或者使用了被污染的菌种，都会造成杂菌大量感染，影响栽培产量。
现将常见的杂菌分述于后：
1、毛霉与根霉：这两种菌的形态相似，菌丝疏松，生长迅速，毛较长，毛霉的菌丝色白，根霉稍带土灰色，成熟后都长出灰色孢子囊。这两种菌都是在多潮和空气不良环境中发展较快。
2、曲霉：分黑曲霉和黄曲霉两种。菌丝较粗短，孢子都是呈辐射状生长。黄曲霉色枯黄，黑曲霉色灰黑。培养基湿度小时，蔓延较快。
3、青霉：为青绿色菌落，分生的饱子便像扫帚，顶端生有分生孢子，喜低温，多在潮湿、空气不良的地方发生。
4、链孢菌：菌丝呈棉絮状，生有长串的链状孢子，菌落为鲜艳的橘黄色，培养基湿度大、温度高时蔓延较快。
5、酵母和细菌：属于单细胞微生物，个体极小，种类繁多，培养基感染此细菌后，表面呈糊状或粘液状，使培养料发粘带臭味，使菌丝死亡。
附：栽培银耳后的培养基的利用
棉籽壳培养基在栽培银耳过程中被菌丝分解，菌丝充满于整个培养基，因而还有可利用的丰富养料，具有关资料，可作猪、牛、羊的饲料。我们经喂猪试验，效果良好，可节约一大部分精饲料。但因使用时间不长，大家可作进一步试验。其他代用料的培养基，可以沤肥。
应注意的问题 ：
（1）所有制种及栽培过程都应按无菌操作的要求进行。
（2）炎热的夏天或严寒的冬天最好不要栽培，如有条件，在夏季要做好降温工作。
方法是：
①在周围环境勤洒水；
②从地道或通井的风洞向室内通风；
③隔严同外界相通的部分，但要不影响光线。冬季主要是保温工作，方法是可用火墙、火炉、地火、地火道等。也可用火炉加烟筒，这几种方法明地火道最理想。温度均匀柔和。火炉的缺点是上下层温差太大。不论哪种方法，都要求室内无煤烟、无二氧化碳气体，并且室内各部温差不要超过2℃。通风时要经过缓冲间，以免冷空气直接袭入，影响银耳生长。
(3)以采收后晒干的银耳，不要挤压防止烂朵。装入大塑料袋内封口保存。置于通风处，以免霉坏变质。