眼下正是银耳出耳管理季节，高温高湿天气很容易滋生各种银耳病虫害，正确防治银耳病虫害是决定银耳产量高低和品质好坏的关键因素。因此，正确防治银耳病虫害可采用以下方法：
一、对绿霉，链孢霉，黄曲霉等竞争性杂菌主要以预防为主，加强堂内通风换气，控温控湿。绿霉已侵入木质部，要用刀刮削，再涂上生石灰水或5%的硫酸铜溶液可起到好的效果；有链雹霉感染的部位，用酒精或柴油涂抹患处，且立即用火烧发病孔处，防止其漫延。
二、当发现耳棒有酸味，长有瓦灰霉时，应将其选出隔离，较重的用火烧掉，防止传染。
三、通过控制喷水量和堂内高温来控制高温高湿烂耳。
细菌性烂耳用刀将烂耳刮去，烂根剜出，用干净布擦去粘液，再一粒四环素片兑水一斤或使用浓度为1:500-600倍农用链霉素液喷洒。
四、如有白粉病出现，要用刀将耳根剜去，涂以浓度为0.5%的石碳酸溶液（苯酚），如果整根耳棒感染，要将病棒扔出耳堂烧掉，以免传染。
五、用1:2000倍液浓度菇虫净喷雾耳棒及耳堂对菇蚊、菌蛆、线虫、跳虫，有杀灭作用；将苦参、苦葛、山野棉皮根的浸出液水兑成1:5倍浓度，喷雾耳堂及耳棒，对螨虫、菌蛆杀灭效果也较好；用1.8%阿维菌素2000-3000倍液浓度喷雾耳堂及耳棒，对螨虫、防治效果良好；用1%的生石灰或0.5%的食盐水喷雾耳堂内外及墙壁，但不能向耳棒喷雾，对蛞喻杀灭和预防效果好。