夏天是气温较高的季节，对子实体生长发育极为不利。管理不善易出现萎蕾烂菇。如何利用栽培保护设施和采取相应措施，制约不良环境的影响？这是夏季有机香菇管理最重要的一个环节。根据主产区经验，主要措施如下：
有机香菇管理1、疏蕾挖株
埋筒菇第一潮正值5月下旬至6月，此时气温较适，菇蕾丛生集中涌现，如果任之发育，会使朵小肉薄，不符合保鲜出口的品质要求，为此必须疏蕾。
有机香菇管理2、遮荫控光
夏日棚温升高，荫棚要用茅草、树枝加盖，避免阳光直射，其光源仅靠四周棚壁草帘缝中透进弱光，一般控制在“一阴九阳”，使整个菇棚处于荫凉暗淡状况。夏季菇棚场地的选择，以旁山依水，空气流畅，光照不强的山坳、河旁为适。如果光强过大，温度升高，有机香菇体变薄，色泽变黄，影响品质。
有机香菇管理3、增湿降温
高温时可采用每天早晚用泉水、井水等温度较低的清水，向棚顶、四周和空间喷雾，使棚内处于凉爽环境。白天在畦沟内灌流动水，夜间排出，并保持浅度蓄水降温。但注意水量的下限，为距离畦床面20厘米，以防蓄水浸蚀菌筒。菌筒较干时，可用清水直接浇到菌筒上，一般每天1次，晴天可多浇些。下雨天及时排除畦沟积水。
有机香菇管理4、加强通风
无论是哪一种栽培方式。夏菇进入子实体生长期，其前期罩盖在畦床上的盖膜不宜密罩，如是1弓1棚或是2-3弓1棚的，都必须把四周薄膜卷离畦床30厘米以上，使畦床之间空气流畅。闷热干燥天气，白天不宜遮膜。如果紧罩薄膜气温升高，二氧化碳浓度增加，必然引起萎蕾烂菇。夏季雷阵雨较多，注意加强通风排湿，可将菇棚四周屏敝遮荫物打开一个通风口，让棚内空气流畅；同时注意检查盖膜有否破漏雨水淋入，避免高温雨淋造成烂菇烂筒现象发生。
有机香菇管理5、经常检查
每天结合采菇，注意观察，发现病虫害或萎蕾、烂菇，应及时摘除，并把烂根铲除，局部用石灰水擦净，防止污染蔓延。强调的是长菇期禁用农药，以免菇体污染影响。
有机香菇管理6、采后管理
夏菇长速较快，从菇蕾到成菇一般1-2天，气温高时半天完成，为此采收是1天采1次，盛发期早晚各1次，保鲜出口菇每天采收4次，如果稍延几小时即开伞，不符合保鲜出口标准，这一点与常规大有差别。一潮菇采收后停止喷水，延长通风时间，让菌筒休养生息，以提高再生菇产量。