栽培条件准备不充分
由于栽培条件准备不够充分或不够重视，存在以下失败的经验教训：
1、培养室、出菇室等清洁度低及忽视消毒。
2、用水的清洁度低。
3、栽培经验不足及解决方法不当。
4、通气方法不正确，设备运行不当。
因此，要保持栽培室的清洁度，每次采收后应彻底地进行消毒；水源要进行定期检查及消毒；通过栽培过程的细心记录和分析，总结成功的经验；利用强制空气循环系统，促进室内空气的交换。
培养期间菌种污染问题
杏鲍菇接完种后，进入培养阶段，在此阶段最重要的是菌种污染问题。其原因主要有：菌种活力减退；冷却室、接种室、培养室空气过滤不良等。因此，在栽培中，应禁止使用长期保存和多次转管使用的菌种，注意菌种的更新换代、筛选，以保持菌种的优良特性，为实现成功栽培把好第一关；保持冷却室、接种室、培养室达到相应的清洁度。
出菇期的问题
由于杏鲍菇采用工厂化生产，只采1茬菇，产量集中在第1茬菇，因此出菇期的管理尤为重要。可能出现以下问题：①菇蕾发生数量多。原因是搔菌后的菌丝恢复生长后，湿度未降至80%～85%而造成的。②培养污染及发生畸形菇。原因是催蕾时湿度过大或通风不良；加湿用水污染；生育室内污染源的增加等。催蕾时应注意改善通气；此期间保持最适湿度80%；采收后进行彻底消毒。③子实体褐变。子实体褐变严重影响菇的品质。原因可能是生育时通气不良及湿度过大；生育室内污染源的增加。过湿时进行通风，防止子实体表面过湿；采收后未进行彻底的消毒。
菌糠利用处理不当
工厂化生产的大量菌糠，处理不好是废物、负担，利用得好则是资源。杏鲍菇工厂化生产中，产量主要集中在第1潮菇，约占总产量的50%。常规杏鲍菇生产通常通过采收3～4潮方能获得全部产量。由于后几潮菇占总产量的比重低，且出菇需要较长的时间，从生产成本考虑，工厂化生产一般只采收1潮菇。杏鲍菇工厂化生产的生物学效率普遍较低。杏鲍菇常规生产，生物学效率可达80%～90%，而工厂化生产的生物效率仅有40%～50%。因此，杏鲍菇生产的废弃物（菌糠）如不经过合理处理，一方面造成污染环境，另一方面造成很大浪费。菌糠是栽培后的培养料，含有丰富的蛋白质、氨基酸及微量元素[2]，在农业生产上具有较高的利用价值。菌糠被广泛用于二次代料栽培食用菌、用作农作物肥料、加工成家畜家禽饲料、生产沼气及作燃料等，做到清洁生产、零排放。例如：杏鲍菇—香菇模式就是利用工厂化栽培杏鲍菇后的菌糠二次栽培香菇模式，很好地提高了其利用率。环境保护和食用菌工厂化生产自身发展的需要都决定了菌糠的处理利用要合理、优化。