美味侧耳ITS序列直接测序与克隆测序比较分析
The Comparative Analysis of the ITS Sequences in Pleurotus sapidus Obtained by Direct and Cloned Sequencing
郑和斌 王作仁 吕作舟 余知和
摘 要：用CTAB法提取美味侧耳基因组DNA,利用引物ITS1和ITS4扩增其核糖体DNA的ITS片段,凝胶回收试剂盒纯化目的片段.通过PCR产物双向直接测序和克隆测序分别获得其rDNA ITS序列,对两种测序方法所得序列及GenBank中美味侧耳ITS片段的序列进行比较分析.结果显示,三条序列的差异非常小,两种测序方法所得序列仅在两端出现差异,序列内部完全一致.
关键词：美味侧耳;ITS;序列测定
分类号：S646.140.1 文献标识码：A
文章编号：1005-9873(2005)01-0001-04
作者简介：郑和斌(1979-),男,华中农业大学应用真菌研究所在读硕士研究生,主要从事侧耳属真菌的系统分类及人工栽培研究.余知和,本文通讯作者
作者单位：郑和斌（华中农业大学植物科技学院,武汉,430070;长江大学生命科学学院,荆州,434025）
王作仁（华中农业大学植物科技学院,武汉,430070）
吕作舟（华中农业大学植物科技学院,武汉,430070）
余知和（长江大学生命科学学院,荆州,434025）
参考文献：
［1］凌建亚,彭俊峰.核糖体DNA ITS区应用于虫草属无性型鉴定的初步研究[J].山东农业大学学报 (理学版),2003,38(3):113～117.
［2］Iwen PC,Hinrichs SH,Rupp ME.Utilization of the internal transcribed spacer regions as molecular targets to detect and identify human fungal pathogens[J].Med Mycol,2002,40:87～109.
［3］Bunyard BA,Chaichuchote S,Nicholson MS,et al.Ribosomal DNA analysis for resolution of genotypic classes of Pleurotus[J].Mycol Res,1996,100 (2): 143～150.
［4］Brower AVZ,DeSalle R,Vogler A.Gene trees,species trees and systematics:acladistic perspective[J].Annu.Rev Ecol Syst,1996,27: 423～450.
［5］马富英,罗信昌.分子标记在食用菌遗传育种中的应用[J].菌物系统,2002,21(1):147～151.
［6］Lnnis MA,Gelfand DH,Sninsky JJ,et al.PCR protocols: A guide to methods and application[M].Academic Press,Inc.San Diego,CA,1990.315～322.
［7］金冬雁,黎孟枫等译,侯云德等校.分子克隆实验指南(第二版)[M].北京:科学出版社,1996.
食用菌学报
ACTA EDULIS FUNGI
2005 Vol.12 No.1 P.1-4
