阴道分离因肯毛孢子菌的分子鉴定和种内分型

【作者】吕雪莲 张晓利 王淼淼 佘晓东 吕桂霞 沈永年 刘维达
【机构】中国医学科学院皮肤病研究所
摘要：分别采用rRNA基因内转录间隔区(ITS)和基因间隔区(IGS1)测序,ITS和IGS1区PCR限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)和基因组DNA的随机扩增多态性DNA(RAPD)等方法,对三株因肯毛孢子菌Trichosporon inkin进行分子特征及种内分型研究。结果显示,不同菌株的rRNA基因ITS区和IGS1区的序列相似性均高达100%,RFLP酶切图谱具有较理想的种内一致性,而不同菌株的RAPD图谱不尽相同。研究表明:rRNA基因IGS1区测序及RFLP酶切可考虑用于因肯毛孢子菌的菌种分子鉴定,而基因组DNA的RAPD则较适合于菌种的种内分型。
基金：科技重大专项(No.2008ZX10004-002)； 卫生部部属(管)医院临床学科重点项目(No.2007.7)； 卫生部公益性行业科研专项经费项目(No.200802032)； 江苏省自然科学基金(No.BK2008091)；
关键词：rRNA基因测序; PCR限制性片段长度多态性分析; 随机扩增多态性DNA;