3.1 灭菌。 装完袋需经过灭菌后才能接种黑木耳。目前常用土蒸锅灭菌，一次可灭菌500～800袋。灭菌时锅内材料不能排列过密，以便蒸汽流动畅通，灭菌彻底。灭菌时间为8～12小时。灭菌时要防止漏气；否则锅内达不到需要的温度影响灭菌效果。
3.2 接种。 接种室大小可根据接种量而定，一般每5－6平方米可接种1万袋。有条件可设置一个冷却间，灭菌后的料袋在冷却间冷却到30℃左右时即可接种。
接种前1－2天要对接种室消毒，具体方法：
①将白灰在接种室内四处扬撒。
②放置5－6堆硫磺和锯未混合物点燃熏24小时。
③用甲醛5－10毫升和5克高锰酸钾混合熏24小时。
接种前，对镊子、接种钳等接种工具应用75％酒精擦拭后点燃消毒，操作人员要用肥皂洗手，并用医用酒精擦拭。接种时将菌种弄成玉米粒大小，用镊了夹出，一手打开培养袋棉塞，一手将菌种放人袋内。一般在培养孔放4－5块，在袋上部周围放4－5块，然后用手在外面按一按，使茵种和培养料充分接触。便于萌发。最后塞上棉塞。
4、对感染性强的污染耳木，菌袋、菌瓶，菌砖应隔离和烧毁。
（三）、药剂防治：
1、用2%生石灰涂刷被杂菌危害部位可抑制杂菌蔓延。
2、若绿霉菌发生在培养料的表面，尚未深入料内时，用PH10的石灰水擦洗患处，可控制绿霉菌的生长。
3、若发现袋内有黄、红、绿、青等颜色的斑块即为杂菌、较轻的可用福尔马林液注射患处，移到另室单独培养，仍有一定产量。